Verifique no site, aplicativo ou agência da Caixa se realmente não está havendo o depósito da maneira correta. Tente resolver com o setor responsável na empresa em que você trabalha, e se ainda assim não conseguir uma resposta justificável, procure um advogado trabalhista para lhe assistir neste problema grave.
Fazer uma denúncia à Caixa Econômica Federal ou até mesmo entrar com uma ação trabalhista podem ser a solução se seu empregador permanecer suprimindo seu direito!